HEPA filtre kan med fordel installeres i rum hvor meget høj luft-renhed er påkrævet. Filterne fremstilles i en plisseret version med termoplastik separatorer eller med aluminium/rustfrit stål separator. Filteret benyttes i omgivelser hvor alle utilsigtede partikler skal frafiltreres f.eks. på hospitaler hvor steril luft er påbudt.
HEPA filteret vil som regel indgå som en del af en komplet filterløsning, da filteret kan benyttes i flere forskellige sammenhæng. Det kan for eksempel bruges som finfilter grundet den kraftige filtreringsgrad. Filteret kan ligeledes benyttes som en del af et omfattende ventilationsanlæg, som har et forfilter med patroner eller et kuvertfilter. Desuden er det også en mulighed at benytte det sammen med et kulfilter – typisk til at fjerne luftgener eller usunde gasarter.
